Hallo DD,
ich kenne nicht die örtlichen Gegebenheiten, aber diese Aussagen
"Somit müssen die MA durch Drehkreuz und werden als abwesend gezählt.
Diese Abwesenheit wird nachher als ZeitGutschrift eingetragen."
regen meinen Widerspruchsgeist.

Scheinbar ist das Drehkreuz nicht nur für die Zutrittskontrolle, sondern auch mit der Zeiterfassung/Anwesenheitskontrolle verbunden.

Mögliche Lösungsvorschläge:
Die Fluchttüre neben dem Drehkreuz wird geöffnet und der Durchgang mit einer Sicherheitskraft temporär besetzt. Ausgang ohne Mitarbeiter-/Firmenausweis / Eingang unter Vorzeigen von Mitarbeiter-/Firmenausweis.

Das Drehkreuz wird in "rastende" Einstellung zum Verlassen des Geländes ohne Zeiterfassung gestellt. Die Aushebung der Sperrfunktion kann ggf. von der Ferne erfolgen oder am Drehkreuz selbst ist dafür ein Schlüsselschalter vorgesehen.

Es kann ein Ausweis ohne Mitarbeiterbezug nur mit Öffnungsfunktion des Drehkreuzes eingesetzt werden, der durch eine Sicherheitskraft zur Anwendung kommt, um die Teilnehmer aus dem Gelände und später wieder auf das Gelände lässt.

Wo ein Wille ist, gibt es auch Lösungen. Es mag sein, dass meine Lösungsvorschläge nicht zu deinem Problem passen. Es soll auch nur zum eigen Nachdenken zur Lösungsfindung anregen.